מגמת צמחי מרפא מערביים כוללת מספר מקצועות המשתלבים לחטיבה משולבת ומגובשת העומדת בפני עצמה, מיחד, ומהווה נדבך חשוב והכרחי במקצוע הנטורופתיה בכלל. רפואת הצמחים היא הרפואה העתיקה ביותר, אשר התפתחה בתרבויות שונות באופן בלתי תלוי בכל ארץ או אזור מגורים, כשהתרופות נלקחו בעיקר מהצמחים המקומיים. בני האדם למדו להעריך את סגולות המרפא של הצמחים, להשתמש בהם כדי לשמור על בריאותם וכדי לטפל בחוליים ומכאובים. הידע עבר בכל התרבויות, ממורה לתלמיד, בתי ספר נפתחו, ולימודי צמחי המרפא היו נושא מרכזי. כיום כל מטפל הוליסטי עושה שימוש בצמחי מרפא בשילוב טכניקות ריפוי נוספות. מדע הכימיה שהתפתח ב-200 השנים האחרונות מוכיח את הידע המסורתי, ומחקרים קליניים תומכים גם הם בכוחם של הצמחים ברפואה טיפולית ומונעת. בשנות ה-30 של המאה העשרים נוסף נדבך חדש ורב עצמה לרפואת הצמחים - הריפוי בתמציות פרחים, תמציות פרחים הידועים כפרחי באך. דר' אדוארד באך - ממציא ומייסד השיטה, הכיר בכך שמתח ממושך הנובע מכעס, פחד או דאגה מחליש את מערכת החיסון, והגוף עלול להיות טרף לזיהומים או מחלות. הוא אף נוכח לדעת שהתייחסותו של האדם למצב הרגשי משפיע על חומרת המחלה, ואנשים אשר סובלים מאותה מחלה, הינם בעלי קווי אישיות דומים. עפ"י באך אין להתייחס למחלה אלא לאישיותו של האדם, שכן המחלה הנה גיבוש וביטוי של מצב רגשי של האדם. פרחי באך כוללים 38 פרחים המחולקים ל-7 קטגוריות ראשיות של מצבים רגשיים. פרחים אלה מאזנים מצבים של חוסר הרמוניה בהבטים נפשיים ורוחניים. הם משנים רגשות כמו פחד, דכדוך ושנאה והופכים אותם לאומץ, שמחה ואהבה. בטיפול בפרחי באך מטפלים בצדדים הפנימיים של המחלות בעקיפין דרך הצד האנרגטי, רגשי חיסוני. הטיפול בפרחי באך מהווה איפוא השלמה לטיפול בצמחי מרפא. לאחרונה נוספו למערכת שיטות הטיפול באמצעות הצומח גם שיטות המסתמכות על פרחים אוסטרליים ועל פרחים אמריקניים. ניתן ללמוד קורס זה בין כהמשך לקורס צמחי מרפא ובין כקורס נפרד.